Небольшой деревянный храм явился предтечей каменного Преображенского собора города Люберцы. Строительство началось в 1993 году фактически силами прихода и через четыре года (1997) здание было освящено в память свт. Иннокентия, митрополита Московского. Архитектура и интерьер выполнены в духе русских рубленных северных храмов и оставляют ощущение духовной теплоты и историчности.

В 2018 году началось строительство приходского комплекса для обеспечения богослужебной и хозяйственной деятельности прихода. Фактически примыкающее к храму здание должно быть объединено с ним общими фасадными решениями.